该剧改编自同名漫画，讲述了在民国时期，拥有嗅觉天赋的少女闻香与上海滩第一神探王涯、天才魔术师莫西共同创办闻香侦探社，侦破离奇案件的同时实现自我蜕变，共同守护正义与法理的故事。
开头以皮影杀人案来引出故事。闻香为了学习探案，来到上海寻找第一神探王涯。在寻人期间碰巧撞上了“皮影害人”的疑案，还遇到了一个蓬头垢面的酒鬼，此时她不知道自己心心念念王涯就在眼前。她以异于常人的嗅觉追踪线索，并与王涯协作用装神弄鬼的法事引出真凶。这时她意外得知身边的酒鬼就是王涯，也是从前在水中救下她的恩人。
真凶的身亡引出了幕后之人无名的一场阴谋，但很快一起魔术表演中的坠亡案又让人陷入谜团。在此案中，他们结识了被囚禁的上海顶流魔术师莫西，同时闻香也弄清了王涯落魄成酒鬼的来龙去脉。
王涯原本是一个意气风发的第一神探，却因为五年前探查地狱杀人案，间接导致好友周宁风的身死。而案件未破，无辜之人受牵连，他一夕之间从第一神探变成了人人讨伐的罪人。出于愧疚与破案不得法门，他失意落魄，成了终日酗酒的酒鬼。闻香为了让他重新振作，与莫西成立了侦探社，并邀请他加入。
在闻香的鼓舞之下，他决定走出阴霾，加入了侦探社，找出无名，查清五年悬案的幕后黑手。三人探案组就此形成，此外还有法医甄言、探长郑义飞，律师周宁鹏和记者张思淼的协助。
整部剧有六个案件，每一个案件的背后，都是人心险恶造成的悲剧。寻找的是真凶，揭露的却是丑恶的人性。 在查清每一宗案件的过程中，王涯串联起的线索都指向在幕后操纵这一切的无名，而无名的真实身份却让所有人都大吃一惊。案件最后揭开了一桩灭门之祸，闻香的身世也被公之于众。
《皮影杀人案》平凡小巷怪事频发，诡异皮影蒙覆血腥。
状元巷泥人徐惨死家中，死像奇特，接着糖画师傅老陈，在家中倒栽在一口水缸里溺亡。几经辗转，根据线索，打听到纸张产于方家纸坊，但方家纸坊已于十五年前消失，方家一家三口不知何因惨遭灭门，凶手指向许海。重新捋顺事情发展经过，基本断定当年方家灭门惨案由许海、泥人徐和糖人陈联手制造。
而凶手是惨遭灭门的方家少爷方天博，当年，亲眼目睹父母被杀的他侥幸活了下来，本来患有先天心疾只能长到十八岁，可他愣是抱着复仇的信念存活至今，埋伏在状元巷行医寻找机会。三个仇人已经解决掉两个，眼看许海也命不久矣。方天博明白自己只有死路一条，愤怒地大喊:世道不公，只能以罪恶洗刷冤屈。然后被击毙。
《玫瑰案》：绝佳搭档信任崩塌，玫瑰凋谢血染舞台。
莫西正筹备一场大型魔术表演，魔术演出当天，在莫西的操纵下，白玫瑰漂浮到舞台顶部，突然失控掉在地上，摔死了。 通过尸检得到结论，白玫瑰死于中毒，即在钢丝绳断裂前已经服毒，懂得魔术原理的，只有张洋和马小马。王涯将自己的分析一步步讲述出来，白玫瑰得了绝症，打算用死让莫西记住一辈子，在表演时，在自己要用的白玫瑰上抹上毒，还有张洋在钢丝绳上动了手脚。 张洋看着掩饰不住，便老实交代，自己一直喜欢白玫瑰，但白玫瑰所有心思都在莫西身上，当初为了莫西能出名，甚至不顾惜自己的贞操，任杨老板摆布，最让他伤心地是，当终于鼓起勇气向白玫瑰表白时，白玫瑰不但没有拒绝，还羞辱了自己的身份。 真假魔术师替身 一直参与破案的，是莫西的双胞胎哥哥莫东。两人从小跟魔术师老乔治学习魔术，但莫西更招人喜欢，经常出现在台前，而莫东只能被当做莫西的替身，有时还要挨打受骂，这一切对于自尊心极强的莫东来说，都是难以承受之重，终于有一次，莫东犯了小错误，被老乔治一气之下卖到美国。 几年后，莫东辗转回国，看到莫西已经成为万众瞩目的魔术师，十分嫉妒，便找机会将弟弟藏在星光剧院的地下暗格，直到汤姆进行搜查，莫东害怕王涯发现暗格里的秘密，假装害怕老鼠直接跑出暗格，才被王涯发现端倪。计划失败，莫东通过魔术消失在舞台上。对莫东发出全城通缉后，第二天早上，便有人报案，发现莫东死在城东。莫西表示眼下不想继续魔术表演，查明哥哥的死因更重要。闻香看到莫西的态度，答应和莫西联手调查无名。
地狱连环案 五年前发生的事，王涯是名震上海滩的第一神探，一度令凶手闻风丧胆，直到有一天，青帮老大独生子以一种奇特的方式从高处坠亡，尸体被找到后，形态诡异，青帮老大开始查找凶手，后来却在追查过程中忽然停止，当时坊间传闻，凶手来自地狱。紧接着，好几起命案接连发生，死者都被绑住双手，以一种赎罪的姿态跪在地上，口里含着棋子。
在第十五起命案即将发生时，凶手露出马脚，被王涯成功阻止。王涯带巡捕队赶到时，周宁风正拿着匕首面对死者，看到王涯，大喊自己不是凶手，担心被抓，就开始逃跑，路上跳河自杀。周宁风跳河后，很快发生了第十六起命案，大家才意识到，周宁风当了替罪羊。周宁风的死严重打击了王涯，从此一蹶不振，仿佛达到了凶手的目的，之后五年间就没再制造过命案。
《叹息之墙》叹息之墙封尸文豪，暗室惊爆女星秘照。
一桩别墅的侧墙上有两个人体形状的污痕。死者窒息而亡，身份为上海大文豪方思远，另一名死者为电影导演吕潇，本来对电影不感兴趣的方思远，在吕潇的新电影上映时，亲自参加首映，还对女演员邱月大加赞赏。 一张被烧掉一多半的照片，从报社近期的照片里找到拍摄者，名为陈雁秋。邱月出名前，和陈雁秋有过一段风花雪月，但陈雁秋性格软弱，后来亲手把邱月送给了别人。
陈雁秋承认是自己杀了方思远和吕潇，因为两人逼自己在别墅暗室给很多女孩拍裸照，后来才认识邱月，并对邱月一见钟情，不久邱月也成了两人的玩物，被关在暗室拍裸照，陈雁秋气愤不过，终于找机会在两人食用的黄豆糕下药，然后将两人封存在叹息之墙，诅咒两人永世进入地狱。说完这些，陈雁秋便坠崖身亡
王涯根据陈行之对陈雁秋的评价，向邱月讲述了自己的推断，陈雁秋和邱月本是一对情侣，邱月一直梦想成为明星，陈雁秋是摄影师，便给邱月拍摄了一些大胆前卫的照片，然后向吕潇推荐。吕潇决定让邱月担任《尘烟如梦》主演，为了电影大卖，吕潇让邱月充当方思远的情妇，好能换取方思远一番评论，最后，两人一起玩弄了邱月，邱月怀恨在心，便在两人的黄豆糕里下药，两人中毒后，将其封存在墙内。但陈雁秋胆小怕事，应该没参与邱月的计划，只是在出事后，猜到邱月所为，才决定勇敢一次，替邱月背负罪名，坠崖身亡。 王涯猜测，凭邱月一人之力，很难将两个成年男子封存在墙内，很可能有无名帮忙，面对这些没有证据的说辞，邱月全部否认，案件就此落下帷幕。《上河运尸案》上河惊现骇人鬼棺，书寓传来隐秘哭声。
书寓近三年失踪二十二名女性，树林里二十位姑娘的尸体被找到。不久后，就有人发现唐三被害，唐三身上被划了二十二刀，正是已知失踪姑娘的数量。
但最近失踪的两名姑娘没有找到，卢小仙提着最后一口气，跟王涯讲述自己曾被唐三活埋，后被一黑衣男子救下，之后开始了对多诺的跟踪，黑衣男子讲过，获得重生后就应该和地狱里的恶魔斗争。
凶手多诺的舅舅是英国国会议员，影响力非常大。而唐三是被黑衣男子所杀，正准备开庭资料时，巧妹忽然失踪，如月已经被害，路易斯出面认罪，抗下所有罪行，当了替罪羊。巧妹被带至多诺的公寓，多诺即将离开上海，想着最后一次霸占巧妹，对巧妹拉扯一番，忽然中毒身亡。王涯赶到时，多诺已经死亡，以一种熟悉的赎罪姿态跪在地上。
《许家灭门案》医者救人却救不了人心。
闻香是灵芝堂许山的女儿，名为许怀香，十五年前家中遇难后，被师傅带去了苏州，在探案中，无名的指引向着许家当年的灭门案。
十五年前，闻香的义父解百药和许山是师兄弟，两人共同经营灵芝堂，周云山到上海投奔王青松，途中妻子阿珍误食红花，致幻癫狂。王青松请许山和解百药医治，两人拿出师傅留下的百草药典治好了阿珍，从此，周云山便开始觊觎百草药典，屡次被许山拒绝。
当时，许山比解百药名气大，解百药本来不服气，被周云山一番劝说，便偷出了百草药典，周云山开始投毒并售卖解药，很快赚了一大笔钱，最后竟直接毒死了许山一家，解百药才明白周云山已经利欲熏心，看许山女儿还没中毒，便急忙带其逃离，躲到苏州乡下。
不久后，周云山妻子阿珍因为体内红花毒素还未完全清除，旧病复发，周云山明白当下能治疗的，只有解百药，周云山便开始四处搜查，但始终没有找到。
周云山不忍爱人受苦，便把阿珍关进了密室。偷偷托半山医院院长鲁鼎研制解毒剂，好治疗阿珍。鲁鼎拿乞丐的身体当做制药的培养皿，死后全部扔入湖里藏尸。
周宁风亲眼见证了父亲犯下的罪行，又碍于亲情无法揭发，精神极度奔溃，便开始寻找另一种自洽的方法，最终把自己变成了无名，法律无法制裁的边缘，便以暴制暴报复恶人。
在公审当天，周云山妻子顾珍作为证人，讲述了当天的经过。解百药临死前，给闻香留下一个香囊，可以破解无名研发的毒剂。周云山知道已经吸入毒气，担心中毒过量后会控制不住自己杀人，便请求闻香无论如何一定要医治顾珍。
为了怕毒性发作伤及闻香，周云山选择了自杀，之后也正是闻香提供的配方治好了自己多年的疾病。周家荣园的红花，也由周云山种植，为了研发治疗顾珍癫病的解毒剂，周云山做了很多错事，但都是为了顾珍。最终周宁风的计划以失败告终。
